به گزارش هنرنیوز؛ سازمان‌های غیردولتی میراث فرهنگی کشور با ارسال نامه ای به نجفی از دلنگرانی های خود جهت خروج آثار از ثبت گفتند. در بخشی از متن این نامه آمده است:
« جناب آقای دکتر نجفی
معاون محترم ريیس جمهور و رييس سازمان میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری کشور

با درود و احترام
همان‌گونه که استحضار داريد سازمان میراث فرهنگی، صنايع دستی و گردشگری یکی از ارکان مهم و متولی اصلی حفظ و احیاء هویت ایران اسلامی می‌باشد که به صراحت به این موضوع در اساسنامه سازمان نيز اشاره شده است و یکی از مهم‌ترین وظایف آن سازمان «ثبت آثار ارزشمند منقول و غیرمنقول فرهنگی- تاریخی کشور در فهرست آثار ملی و فهرست‌های ذیربط» عنوان گردیده است. تاکنون بیش از ۳۰ هزار اثر در این فهرست ثبت و ۱۶ اثر نیز در فهرست جهانی قرار گرفته است.

متاسفانه از ابتدای دولت نهم، شاهد ثبت حساب نشده و همراه با پرونده‌های ناقص در مورد آثار و بناهای تاریخی کشور بوده‌ایم که این اتفاق به هیچ وجه به صلاح هویت کشور نبود و آرام آرام به یک معضل برای کشور و سازمان میراث فرهنگی تبدیل شد و بحرانی با نام "خروج آثار تاریخی از فهرست میراث ملی کشور" را به دنبال داشت.

روند فعلی خروج آثار تاریخی کشور از ثبت و تخریب‌های ناشی از آن، نگران‌کننده و نشان‌دهنده تخلف‌ها و کوتاهی بخش‌های مرتبط در این موضوع همچون اداره کل‌حقوقی سازمان میراث فرهنگی کشور و گاهی در استان‌ها و دفتر ثبت آثار کشور در سال‌های گذشته است.

در اثر عدم رعایت موازین حقوقی در ثبت بناهای تاريخی و جبران نشدن حق "عدم النفع" مالکان از ثبت آثار تاریخی، به تدريج مالکان از سازمان میراث فرهنگی در دیوان عدالت اداری طرح شکایت کردند و از اواخر سال ۱۳۸۹ اولین اثر تاریخی کشور از ثبت خارج و تخریب شد و تاکنون بر اساس اطلاعات موجود، ده‌ها اثر تاریخی در کشور از ثبت خارج شده است. این موضوع از تهران آغاز و امروز در بيشتر نقاط کشور از جمله استان‌هايی چون اصفهان، خوزستان، فارس، همدان، یزد و غيره همه‌گیر شده است. اين موضوع تا آن‌جا پيش رفته که حریم کاخ گلستان به عنوان اولین اثر ثبت جهانی پایتخت و شانزدهمین اثر ثبت جهانی ایران، با رأی اخیر دیوان عدالت اداری شکسته شده و این اثر جهانی را در معرض خطر قرار گرفتن در فهرست میراث در خطر جهانی و حتی خروج از لیست آثار جهانی یونسکو قرار داده است.

اکنون با توجه به نگاه مثبت شما به موضوع ثبت آثار تاریخی و شأن ثبت در فهرست میراث ملی کشور به عنوان بخشی از هویت میلیون‌ها ایرانی و ديگر جهانيان، ما سازمان‌های غيردولتی فعال در زمينه ميراث فرهنگی کشور درخواست رسیدگی و شفاف‌سازی و ارايه گزارش آن به افکار عمومی، برخورد با متخلفان احتمالی و رفع ريشه‌های این بحران و بازگرداندن جایگاه ثبت آثار تاریخی در افکار عمومی از شما می‌باشیم.
...»